Western Blot 全流程:从提蛋白到显影
这项技术是干什么的
Western Blot(蛋白免疫印迹,简称 WB)回答的是一个很直接的问题:我的样品里有没有某个蛋白?有多少?它是生物医学实验室出镜率最高的实验之一——验证基因敲除是否成功、看药物处理后某个蛋白的表达变化、检测信号通路激活(磷酸化),都离不开它。本组目前主要用它检测 MLE-12 细胞(山奈酚预处理后 erastin 或 LPS 诱导)中的铁死亡相关蛋白(GPX4、SLC7A11、ACSL4 等,课题背景见 课题总览)。
一句话概括原理:先把样品里的蛋白按分子量大小用电泳分开,再把这些蛋白「印」到一张膜上,然后用抗体像探针一样去特异性识别你要的那个蛋白,最后通过化学反应发光显影,成为一条肉眼可见的「条带」。
目的蛋白:你想检测的那个蛋白;内参蛋白:每个细胞都稳定大量表达的蛋白(如 β-actin、GAPDH),用来证明「每个孔上样量一样」;抗体:识别工具,一抗认目的蛋白,二抗认一抗并带着发光的「灯泡」(HRP 酶)。
基本原理
转膜之后,膜上「平铺」着所有蛋白。检测就像叠罗汉:一抗特异性结合目的蛋白 → 带有 HRP(辣根过氧化物酶)的二抗结合一抗 → 加入 ECL 底物后 HRP 催化反应发光 → 胶片或成像仪捕捉光信号。
完整流程总览
整个实验从收细胞到出结果一般需要 2~3 天(其中一抗孵育过夜占一晚)。先建立整体地图,再逐步细看:
分步详解与关键参数(本组标准流程)
下面各步的参数均为本组实际操作标准:与文献或试剂说明书不一致时,组内一律按这里的来(不同实验室条件不同,我们组按此标准操作)。
1. 裂解提蛋白:快、冷、加抑制剂
裂解液用 RIPA(含蛋白酶抑制剂;测磷酸化蛋白再加磷酸酶抑制剂),全程冰上操作。组织、细胞两条路线:
- 组织:称重后置冰上,每 20 mg 组织加 100 μL RIPA 裂解液,剪碎,组织破碎仪充分破碎,冰上静置 30 min;
- 细胞:直接加 RIPA 裂解,冰上静置 10 min;
- 离心与保存:4 ℃、12000 rpm 离心 10 min,取上清装入离心管,-80 ℃ 保存;
- 为什么全程冰上:蛋白在室温下会被样品自带的蛋白酶降解。
- 为什么测磷酸化必须加磷酸酶抑制剂:否则磷酸基团会被迅速水解,p-蛋白条带消失。
2. BCA 定量:让每个孔「起点公平」
本组按 BCA 试剂盒做标准曲线定量,操作如下:
- 工作液按试剂盒说明 A:B = 50:1 配制,充分混匀;
- 标准品与样品各 20 μL 加入 96 孔板(样品有限时可各取 10 μL,保持样品:工作液 = 1:20);
- 每孔加 200 μL 工作液,振荡器震荡 15 s 混匀;
- 封板 37 ℃ 孵育 30 min,冷却至室温后测 562 nm 吸光值,做标准曲线计算浓度。
算出浓度后把所有样品用裂解液调到同一浓度,再统一加入 5×Loading Buffer(终浓度 1×)。
本组每孔上样 20 μg 总蛋白。先把所有样品调到同一浓度,后面只加同体积就能保证上样量一致——这是内参条带齐不齐的前提。
3. 变性与上样
样品加上样缓冲液后 100 ℃ 煮 5 min 变性,瞬时离心把挂壁液体甩下来(个别易聚合的跨膜蛋白才用 70 ℃ 10 分钟的温和条件,常规样品一律按 100 ℃ 走)。上样按含 20 μg 蛋白的体积计算,最左孔加 5 μL marker;记好上样顺序图,建议用排枪或记号笔在膜上做角标。
4. 配胶与电泳:电压与凝胶浓度的选择
配胶:按目的蛋白分子量选分离胶浓度,配方按试剂说明书配制;浓缩胶统一 5%。玻璃板清水洗净晾干;灌分离胶至合适高度后加一层无水乙醇液封,待其凝固后倒掉乙醇,再灌浓缩胶、插梳子。凝胶浓度决定分离范围:
| 目的蛋白分子量 | 推荐分离胶浓度 | 说明 |
|---|---|---|
| 10~30 kDa(小) | 12%~15% | 胶越浓,小蛋白分得越开 |
| 30~120 kDa(大多数) | 10%~12% | 常用默认选择 |
| 120~300 kDa(大) | 6%~8% | 大蛋白用低浓度胶,转膜时间也要延长 |
电泳:80 V 约 30 min(浓缩胶,让样品「排齐」),样品进入分离胶后调 120 V 约 90 min(恒压),跑至染料前沿接近底部。
5. 转膜:方向别搞反
PVDF 膜先在甲醇中活化 2 min(NC 膜不用),再在转膜缓冲液中平衡。按本组口诀组装「转膜三明治」:海绵-滤纸-黑(胶)-白(膜)-滤纸-海绵;叠好后在胶上做标记,防止膜的反正面搞错。
本组湿转条件:300 mA 恒流、冰上 120 min,并按目的蛋白分子量调整转膜条件、胶浓度与胶厚度(不同实验室条件不同,我们组按此标准)。小分子蛋白(<30 kDa)注意别转过头(可用 0.2 μm 膜、缩短时间);大分子蛋白(>150 kDa)适当延长转膜时间。
6. 封闭与抗体孵育
- 封闭:5% 脱脂奶粉(TBST 配制)。转膜结束先用 TBST 洗 5 min,再室温摇床封闭 1 h。注意:检测磷酸化蛋白建议改用 5% BSA,奶粉中的酪蛋白可能有磷酸化类似物导致背景。
- 一抗:用 5% 脱脂奶粉稀释,比例按抗体灵敏度选择(从说明书推荐稀释度起步摸索),4 ℃ 摇床过夜,用量约 4~5 mL。
- 洗一抗:TBST 3 次 × 10 min,洗掉未结合抗体(背景高的元凶多在洗涤不充分)。
- 二抗:5% 脱脂奶粉稀释,比例一般 1:3000,室温摇床 2 h。
- 洗二抗:TBST 3 次 × 5 min。
- 二抗的种属要匹配一抗:一抗是兔源的,就用「羊抗兔-HRP」二抗。
7. ECL 显影
按 ECL A 液:B 液 = 1:1 混匀后加入发光盒,放入 PVDF 膜反应 5 min,直接用数码成像设备显影,扫描保存。选不饱和曝光的图像做定量——过曝的条带「白心」是无法比较灰度的。
膜重复利用:蛋白样品及抗体特别珍贵时,可用 Stripping buffer 洗脱掉已结合的抗体,重新封闭后再孵育下一轮抗体(注意事项见下方组内信息)。
常见问题排查表
| 现象 | 可能原因 | 解决办法 |
|---|---|---|
| 没有条带 | 抗体失效/稀释度不对;转膜失败;蛋白量太低;目的蛋白在该细胞不表达 | 先跑阳性对照裂解液;用丽春红染膜确认转膜成功;查文献确认表达量 |
| 整片高背景 | 封闭不足;洗涤不充分;抗体浓度过高;膜干了 | 延长封闭至 2 小时;增加洗膜次数和时长;抗体稀释 2~5 倍;全程保持膜湿润 |
| 出现多条带 | 蛋白降解;非特异结合;目的蛋白本身有剪切/修饰形式 | 确认抑制剂新鲜;提高封闭液浓度/一抗特异性;查 UniProt 确认异构体大小 |
| 条带拖尾/笑脸 | 上样量过大;电泳过热;样品盐浓度过高 | 减少上样量至 20 μg;降低电压、4 ℃ 电泳;样品透析或控制裂解液体积 |
| 内参不齐 | 定量不准;上样误差;边缘孔蒸发 | 重新定量;用排枪上样;尽量不用最边缘的孔 |
| 条带发白(反白) | 曝光过度或抗体过量 | 缩短曝光时间、稀释抗体,选线性范围内的图像 |
结果怎么看
拿到膜图后第一步看三件事:① Marker 位置——条带出现的分子量是否与目的蛋白理论值一致;② 内参是否齐——不齐则上样有问题,需重跑;③ 条带形状是否清晰锐利。定量时用 ImageJ 等软件做灰度分析:目的蛋白灰度 ÷ 内参灰度 = 校正后表达量,再在组间比较。
严谨性红线(务必阅读)
- 不允许把不同膜/不同次实验的条带拼在同一张图里而不加任何说明(如裁剪拼接必须注明,并用分隔线标出);
- 不允许对目的蛋白和内参进行不对称的对比度/灰度调整来「美化」定量结果;
- 不允许裁掉与研究结论不符的条带,或选择性展示重复次数不足的结果;
- 原始膜图(含全膜扫描)和未处理的成像文件必须完整归档保存,投稿和答辩都可能被要求提供;
- 定量比较应基于≥3 次独立重复,用统计检验,而不是「挑一张好看的」。
组内信息
- 样品背景:MLE-12 细胞,山奈酚预处理后加 erastin 或 LPS 诱导(课题见 课题总览)
- 拟检测指标:铁死亡相关蛋白(GPX4、SLC7A11、ACSL4 等,详见 铁死亡一篇的检测指标表),具体抗体清单待定——确定后把公司、货号与稀释比例补在这里
- 内参:β-actin / GAPDH(视目的蛋白分子量选择错开的内参)
- ECL 与成像设备:ECL 试剂的存放位置、数码成像设备所在房间及使用登记方式待补充
- Stripping buffer 使用注意:仅在样品或抗体特别珍贵时用于膜重复利用;洗脱后先孵内参确认剥脱干净,再孵下一轮抗体;同一张膜反复洗脱会逐次损失蛋白信号,次数尽量控制在 2~3 次以内
学完之后
建议的下一步:先跟着师兄师姐完整看一次操作(重点看转膜组装和上样),再用成熟的阳性样品(如实验室常规细胞的 β-actin)独立重复一次全流程,确认手上流程跑通后再上自己的样品。检测 RNA 水平请继续阅读 qPCR 教程。